MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Mycoplasma suis str. Illinois chromosome

Total Repeats: 2645

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015155	AAT	2	6	1070	1075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015155	TAT	2	6	1086	1091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015155	ATT	2	6	1094	1099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015155	T	6	6	1098	1103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015155	TTA	2	6	1106	1111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015155	ATTA	3	12	1120	1131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015155	TAAAT	2	10	1133	1142	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015155	TTAA	2	8	1150	1157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015155	TAGA	3	12	1160	1171	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015155	TTA	2	6	1172	1177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015155	ATTA	3	12	1179	1190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015155	TA	4	8	5882	5889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015155	T	6	6	6201	6206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015155	ATT	2	6	6212	6217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015155	ACTAA	2	10	6279	6288	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_015155	CTT	2	6	6309	6314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015155	TACT	2	8	6345	6352	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_015155	AGA	2	6	6370	6375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015155	T	7	7	6637	6643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015155	AAC	2	6	7706	7711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015155	TAGG	2	8	9729	9736	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015155	AAC	2	6	11040	11045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015155	TAA	2	6	12641	12646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015155	TC	3	6	13683	13688	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015155	AAT	2	6	13698	13703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015155	TTA	2	6	13738	13743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015155	TAA	2	6	16290	16295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015155	CTT	2	6	16377	16382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015155	TTAA	2	8	16395	16402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015155	AAT	2	6	17744	17749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015155	TCCC	2	8	17774	17781	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
32	NC_015155	AGG	2	6	17790	17795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015155	A	6	6	17799	17804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015155	TCT	2	6	17810	17815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015155	CA	3	6	19314	19319	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015155	TGG	2	6	19482	19487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015155	CATG	3	12	19586	19597	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_015155	TG	3	6	19609	19614	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015155	A	6	6	19640	19645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015155	GGC	2	6	19647	19652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015155	CAG	2	6	19655	19660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015155	ACT	2	6	19758	19763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015155	TAG	2	6	19778	19783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015155	TAAATC	2	12	19791	19802	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_015155	TAGATT	2	12	19813	19824	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015155	ACTAAC	2	12	19847	19858	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015155	T	6	6	22550	22555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015155	A	7	7	22566	22572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015155	CTT	2	6	22598	22603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015155	A	6	6	22625	22630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015155	TAA	2	6	22632	22637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015155	ATT	2	6	22638	22643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015155	AGT	2	6	27304	27309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015155	TAA	2	6	29461	29466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015155	TAGT	2	8	29468	29475	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015155	C	7	7	29929	29935	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
57	NC_015155	T	7	7	29936	29942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015155	G	6	6	29944	29949	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015155	T	7	7	29977	29983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015155	GAAAAA	2	12	29986	29997	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015155	T	7	7	30008	30014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015155	TA	3	6	30027	30032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015155	CTTT	2	8	30037	30044	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_015155	TAA	2	6	30055	30060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015155	A	8	8	30079	30086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015155	TAA	2	6	30093	30098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015155	TCT	2	6	30110	30115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015155	A	6	6	30122	30127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015155	ATAA	2	8	30133	30140	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015155	TC	3	6	30149	30154	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_015155	AGA	2	6	30171	30176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015155	TACT	2	8	30182	30189	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_015155	T	7	7	33068	33074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015155	T	6	6	33080	33085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015155	A	6	6	33101	33106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015155	A	6	6	33115	33120	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015155	A	6	6	33168	33173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015155	TTAAAA	2	12	34991	35002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015155	AAAT	2	8	35020	35027	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015155	AGT	2	6	36960	36965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015155	TTAAAA	2	12	36999	37010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015155	TTC	2	6	39222	39227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015155	AGA	2	6	39249	39254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015155	AAAG	2	8	39255	39262	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015155	AAG	2	6	39443	39448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015155	TCA	2	6	39456	39461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015155	TGTAG	2	10	39737	39746	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015155	ATG	2	6	39753	39758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015155	T	6	6	39796	39801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015155	TTAAAA	2	12	39839	39850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015155	ATT	2	6	40843	40848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015155	AAT	2	6	43666	43671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015155	AG	3	6	43683	43688	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015155	A	7	7	43703	43709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015155	TAG	3	9	43738	43746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015155	AAGA	2	8	46557	46564	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015155	AGA	2	6	46634	46639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015155	A	6	6	46685	46690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015155	TAG	2	6	46701	46706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015155	A	6	6	46718	46723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015155	TTA	2	6	46747	46752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015155	AGTA	2	8	46780	46787	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015155	ATT	2	6	46790	46795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015155	TAA	2	6	48236	48241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015155	T	6	6	48250	48255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015155	CTAA	2	8	48298	48305	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_015155	TAG	2	6	48313	48318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015155	AGTT	2	8	48329	48336	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015155	AGC	2	6	49109	49114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015155	TTAG	2	8	49163	49170	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015155	TTAA	2	8	50126	50133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015155	AGT	2	6	50755	50760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015155	TCT	2	6	50784	50789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015155	AAG	2	6	50796	50801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015155	T	6	6	50815	50820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015155	TAATT	2	10	50843	50852	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015155	T	7	7	53870	53876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015155	A	6	6	53890	53895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015155	A	6	6	53913	53918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015155	ACT	2	6	53922	53927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015155	A	6	6	53973	53978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015155	TTTA	2	8	53979	53986	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015155	CCT	2	6	54060	54065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_015155	A	6	6	54099	54104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015155	T	6	6	54122	54127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015155	ATT	2	6	54133	54138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015155	CAA	2	6	54155	54160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015155	ATT	2	6	54161	54166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015155	AAG	2	6	54186	54191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015155	AAC	2	6	54210	54215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_015155	GAA	2	6	55401	55406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015155	A	6	6	55410	55415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015155	C	6	6	55460	55465	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
134	NC_015155	TTAT	2	8	55473	55480	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015155	ATTA	3	12	55482	55493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015155	GGA	2	6	55496	55501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015155	TTAA	2	8	55527	55534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015155	ATTA	2	8	55550	55557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015155	ACA	2	6	55572	55577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_015155	ATT	2	6	55586	55591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015155	ATTA	2	8	57056	57063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015155	A	6	6	61978	61983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015155	TAG	2	6	62705	62710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015155	AGT	2	6	62718	62723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015155	TAAA	2	8	62724	62731	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015155	TAGT	2	8	62732	62739	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015155	TCT	2	6	62743	62748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_015155	A	6	6	62752	62757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015155	AGA	2	6	62793	62798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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